Prelevato mediante puntura lombare a scopo diagnostico, il liquor può essere sottoposto ad analisi macroscopica, microscopico-citologica, chimico-immunologica e batteriologica. L’aspetto (limpido, opalescente, torbido) è il primo parametro esaminato. La valutazione del contenuto proteico e l’analisi elettroforetica forniscono dati di fondamentale importanza clinica.
Con l’immunoelettroforesi è possibile evidenziare la presenza di immunoglobuline IgG, IgA, IgM e, confrontando questi dati con quelli ricavati dal plasma, capire se la presenza di immunoglobuline è dovuta a produzione all’interno del sistema nervoso centrale o a passaggio dal plasma attraverso la barriera ematoencefalica. Si possono eseguire test sierologici, per evidenziare la presenza di anticorpi specifici, così come ricerche batteriologiche e virologiche, dirette e colturali.